制造工艺落后也是导致中药注射剂产生不良反应的因素之一。从中药注射剂制备工艺调查中发现，采用提取有效成分单体占5.50%，提取有效部位占12.84%，水煎醇沉占32.11%，醇提水沉占8.26%，水蒸气蒸馏占10.09%，综合法占17.3%；除去12个保密品种工艺不得而知外，其余97个品种中，很少有新方法、新技术、新工艺的应用。
杜守颖认为，加快提高工艺技术水平是当务之急。如导致中药注射剂不良反应的原因之一是注射剂中的杂质残留、颗粒过大。而微孔滤膜技术、超滤等现代先进的技术如果能在中药注射剂生产中推广，将能解决注射剂中的杂质残留、颗粒过大的问题，从而大大提高中药注射剂的质量。但按照国家的有关规定，厂家要进行工艺改进，就必须重新申报，中药注射剂的药理、毒理、临床试验等相关研究就要重新进行，而在销售价格上国家并没有鼓励政策。于是生产厂家为了节约成本，就按照几十年前的工艺进行生产。杜守颖认为，国家应该制定相应的措施鼓励生产厂家进行制备工艺研究和技术改进、提高，只有这样，中药注射剂的安全性才能提高。
4、再评价：构筑安全屏障确保用药安全
近3年来，中药注射剂的不良反应在数量上增幅较大、品种也较多，国家药品不良反应监测中心曾先后通报了清开灵、双黄连、葛根素、穿琥宁、参麦、鱼腥草、莲必治等注射剂的不良反应，并对葛根素注射剂的说明书作了修订。周超凡认为：“中药注射剂是我国独创的中药新剂型，其化学成分非常复杂、制备工艺有待完善、质量标准不够合理、临床疗效缺乏严格观察。因此迫切需要从安全性、有效性、处方的合理性和工艺等方面对其进行上市后的再评价。不要因为不良反应毁了中药注射剂。”
周超凡说，同其他药品一样，中药注射剂上市前所做的动物实验和临床试验，限于动物种属、受试人群、观察病种、用药情况等因素，很难准确预测日后大量用于临床的安全性，因此需要对其上市后的安全性进行再评价。只有再评价，才可及时找出产生问题的环节并修正问题，这样，引起质量问题和不良反应的不确定因素就可减少。
药品上市后再评价工作在我国刚刚起步。王丽霞建议，使用中药注射剂的医院应该严格按照国家有关部门制定的药品不良反应监测的要求，及时、准确地反映中药注射剂在使用过程中出现的不良反应情况，以便给有关部门对药品进行再评价提供参考。北京协和医院药剂科主任李大魁建议，有关部门应该把临床评估列入对中药注射剂的考评范围，应先采取“试字号”运行两三年，然后再发正式的生产批准文号，以确保患者用药安全。