近年来，哈药集团把研发中心的建立纳入到集团的整体发展框架中，投资1亿多元打造了新药研发创新平台，并探索出了独具特色的“一个中心五个分中心”（一个国家级企业技术中心，以及生物工程药品、抗生素、现代中药、新型制剂等五个研究中心的新药研发体系）。通过这六个平台，集中力量对自己有优势的核心技术、核心产品进行深入研发，加快由完全仿制到创新研发方向的转移步伐。
哈药新一届领导班子提出了市场、研发两头并重的发展战略，坚持以产品结构调整为主线，以技术进步为支撑，以抗生素上规模和生物技术及中药现代化为切入点，精心培育企业的技术创新能力。继哈药集团及其控股上市公司———哈药集团股份有限公司先后被国家科技部确定为“国家认定企业技术中心”。经国家科技部、国务院国资委及中华全国总工会等有关部门综合评定，哈药集团旗下的另一家上市公司———三精制药股份有限公司被确定为“国家创新型企业试点”，并成为东北三省制药行业唯一一家入围的企业。哈药集团世一堂制药厂被国家科技部认定为国家火炬计划重点高新技术企业。
在积极构建以企业为主体、市场为导向、产学研相结合的技术创新体系的同时，他们以重大项目、创新能力、环境建设为抓手，全面强化集团科技工作，以多种形式，积极参与国家实验室建设。继2005年哈药集团制药总厂被省科技厅列为黑龙江省抗生素工程技术研究中心之后，三精制药又于日前被确认为“黑龙江省药物制剂工程技术研究中心”。该工程技术中心将在自主研发新产品的基础上，为省内企业提供标准制定等药学申报资料服务以及药品生产技术服务，从而全面带动黑龙江省医药工业技术水平的提高。
2006年12月，三精制药科研中心被省科技厅确定为“黑龙江省重点西药制剂实验室”，并成为集团公司第一个省级重点实验室。该实验室将实行“开放、流动、联合、竞争”的运行机制，建设组织科学研究、聚集和培育科学技术人才、开展学术交流的基地。