始于2000年的我国城镇医药卫生体制改革正步入攻坚阶段。在此背景下，医疗服务征税制度也引起了更多的关注和讨论。
营利性医疗机构存在“税收歧视”
医改之前，根据《中华人民共和国营业税暂行条例》及其实施细则规定，对医院、诊所和其他医疗机构提供的医疗服务，免征营业税。2000年医改后，开始实施《关于医疗卫生机构有关税收政策的通知》，调整和明确了新的医疗卫生机构有关税收政策。
新税收政策规定，对非营利性医疗机构按照国家规定的价格取得的医疗服务收入，免征营业税。不按照国家规定价格取得的医疗服务收入不得享受这项政策。对其从事非医疗服务取得的收入，如租赁收入、财产转让收入、培训收入、对外投资收入等，应按规定征收营业税及其它各项税收。
对营利性医疗机构取得的收入，按规定征收各项税收。但如果将取得的收入直接用于改善医疗卫生条件的，自其取得执业登记之日起，3年内免征医疗服务收入营业税。
对疾病控制机构和妇幼保健机构等卫生机构，按照国家规定的价格取得的卫生服务收入（含疫苗接种和调拨、销售收入），免征营业税及其它各项税收。不按照国家规定的价格取得的卫生服务收入不得享受这项政策。
可以看出，现行医疗服务征税政策的出台，是为了配合医疗机构分类管理制度的实施。目前对该项税收政策的意见，主要集中在两个方面：一是对营利性医疗机构存在税收歧视；二是营利性医疗机构收入少税负重，难以发展。
7方面完善现有医疗服务征税制度
医疗服务是一项特殊的社会服务，在一定程度上具有福利和公益的特征，与人民群众的健康幸福密切相关。医疗服务征税体系建设，既要体现支持医疗卫生事业发展的要求，又要能够促进城镇医药卫生体制改革步伐。根据现行征税政策的具体执行情况，笔者认为，可初步从以下方面考虑完善医疗服务项目征税。