２００７年１月８日新华社“新华视点”栏目播发《是手术还是骗术？－－上海协和医院妇科诊疗案调查》一文后，引发社会各界高度关注。上海市卫生行政部门６日正式宣布：经进一步调查取证，上海协和医院医疗执业活动中确实存在违法违规行为，据此，正式吊销上海协和医院《医疗机构执业许可证》。
上海市卫生局表示：经过查实，上海协和医院在医疗执业活动中违反了医疗诊疗常规、规范，并存在违反国家相关消毒管理、医疗废物管理、医疗广告管理规定等违法违规行为。根据相关卫生法律法规的规定，上海市、区卫生行政部门对上海协和医院给予警告、罚款、吊销《医疗机构执业许可证》的行政处罚，对医院有严重违法违规行为的医师给予暂停执业活动六个月的行政处罚。
同时，上海市卫生局要求各级各类医疗机构严格按照法律法规、诊疗常规和技术规范的要求开展医疗执业活动。上海市各级卫生行政部门要加强对辖区内医疗机构的监管，严格医疗机构、人员和技术的准入，切实加强全行业管理。上海市卫生局还表示，对于损害患者健康权益的行为，不管发生在公立医疗机构还是民营医疗机构，卫生行政部门都将依法严肃查处，绝不姑息。
据悉，２００７年１月８日，稿件播发的当天晚上，上海市卫生局连夜部署查处工作，并表示将对上海协和医院的医疗问题将予以严厉查处；１月１９日，上海市卫生局公开发布对上海协和医院的初步调查结果为“上海协和医院存在过度检查和不当治疗行为，违反了相关的诊疗常规和基本操作规范的规定”，以及“上海协和医院存在涉嫌违法发布医疗广告等违法行为”。
据上海市卫生局透露，近两年来，卫生行政部门已对上海协和医院诊疗活动超出登记范围、使用非卫生技术人员、擅自开展母婴保健服务等问题给予了四次行政处罚，并取消了医院一年的《医疗广告证明》。