那么药房托管是否会给医院带来损失？“医院收入也是增加的。”南京市雨花区铁心桥社区卫生服务中心主任朱家翔分析说，“药房托管”减少了流通环节，交易成本降低；由专门的医药公司管理，医院也不再承担药品霉变等损耗带来的损失。由于托管后患者的医疗费用下降，就诊人数增加，带来诊疗费用比例的上升，再加上政府财政投入适当增加等因素，均使医院收入增加。
也有人质疑35％给医院的高额返利会导致医药公司利润过低而难以为继，南京医药公司董事长周耀平表示，该公司一年的营业额80个亿，受托之后，发挥规模的优势，降低品种的采购成本，从现在的平均水平看，35％是可以做到的。截至目前，南京医药公司在竞标中拿到了93％以上的医院药房托管权。2006年，“南京医药”作为上市公司，从4月到11月间，市值增长近三倍，股票从3元多涨到8元多，平均每个月涨幅近20％。
陈绍泽认为，药房托管，需要保证医院的基本利益，并挤出空间让给老百姓，托管公司也要有微利，三方共赢才能够托得住。
据他介绍，托管企业的药品购进和销售全透明，卫生局和药监局可随时通过密码进入南京医药公司的网站，看到该公司网上采购药品的价格到医院的销售价格，“政府有一整套的监管措施来保证托管企业不会为了实现自己的利益最大化而去侵害患者的利益。”
南京市卫生局有关领导归纳药房托管至少有三点益处：一是直接惠及百姓；二是减少了药商与医生之间明目张胆的利益勾结；三是便于政府监管。
无法打消的疑虑
尽管陈绍泽最近在央视《对话》栏目中较为详尽地阐释了南京药房托管的做法和目的，但仍然无法打消人们的疑虑。
重庆惠民医疗促进会秘书长李捷认为，医院在药品销售收入中分成比例过高，这就会促使医院、医生和医药商业公司之间形成一个新的利益共同体。
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