清热解毒、生津止渴、清热祛湿这些功效一直是广东消费者钟情凉茶的一大原因。按照植物饮料(含凉茶)》标准征求意见稿的要求，经认定为“文化遗产”的凉茶产品，在包装上、宣传资料上可使用“经广东省食品文化遗产认定委员会认定的凉茶配方”为专用术语，而其他非经认定的植物饮料，则不得标注功效说明。
不过，目前获得非物质遗产代表的凉茶秘方和术语的企业只有21家企业54个配方，而在凉茶铺多于米埔的广东地区，失去"功效"优势的企业是否统统都要被淘汰出局？
凉茶新竞品牌清熙堂凉茶的负责人李永健颇为疑惑，他在接受记者采访时表示，能获得非物质文化遗产保护的只有少数企业，对于一些行业的新品牌，例如其企业所生产的葛根系列凉茶冲剂，原材料葛根也是被认定的食品文化遗产配方原料之一。申遗成功的企业可宣传凉茶的功效，没有获得认定的品牌，就不能宣传功效，如何兼顾这两者的公平性是行业需要考虑的一个问题。
争议3 标准存地方保护主义色彩？
有企业代表在意见征询会上指出，国家认定凉茶为国家非物质文化遗产，是在保护整个行业的发展，并非只是保护某个地域的企业，因此凉茶的定义存在垄断行为。标准的制定在于规范整个行业的发展，让各个企业能共同竞争。“我们现在出个广东地方标准，广西也同样可以制定个地方标准来保护当地的企业，互相挟制。”
一企业代表指出，凉茶是一个公共资源，将行业的利益集结于已经得到广东省食品遗产认定委员会认定的少数企业上，显然对于其他企业来说是不公平的。但是，凉茶申遗成功有利于保护凉茶文化，行业标准的制定有利于将质量和配方不过关的小企业淘汰出局，起到规范行业发展的作用，这些又是显而易见的。
同时，也有企业代表认为，国家非物质文化遗产保护是文化层面上的保护，它和地方标准是两回事。以是否获得认证来定义凉茶，会使得企业花冤枉钱，走冤枉路。而且会形成多层管理的困难。标准才是企业行动的指南。
争议4 散装凉茶常温下保质12小时如何保证？
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