日本仍是福建省烤鳗的主要出口地，对日本出口烤鳗七千九百余吨、价值零点八九亿美元，分别占同期烤鳗出口总量值的百分之八十七点九和百分之八十七点三。
作为烤鳗出口的主要目的地，日本自二00六年五月末起实施《肯定列表制度》，其中对输日鳗鱼产品监测项目达一百一十六种之多。在严苛的标准下，福建烤鳗出口受到极大影响。但在政府、商会及企业的共同努力下，福建烤鳗生产企业主动加强产品检测，鳗鱼的质量安全切实得到保证，对日本出口也在逐步恢复中。
福州海关有关人士指出，福建鳗鱼养殖主要用于出口，而且主要销往日本，销售途径过于单一。过分依赖日本市场常使福建烤鳗受制于日本，一旦日本限制进口，福建的鳗鱼就会陷入全面的滞销状态，从而影响鳗鱼行业的发展。
近年来，日本不断提高对烤鳗的检验检疫标准，导致福建鳗鱼产品出口日本频频受阻，从二00三年“恩诺沙星”事件到二00五年“孔雀石绿”事件，再到二00六年的“肯定列表制度”，福建鳗鱼业经历了多次产业低谷。因此，单一的出口格局是制约鳗鱼业发展的一大问题，实现销售渠道的多元化才是当前鳗鱼业受制日本的有效破解之道。
从一季度出口看，福建烤鳗对东盟、欧洲、俄罗斯出口增幅分别达到了五点四倍、四点三倍和三点一倍，但出口量仅在几十吨左右，在总体出口中所占比重偏小。