魏山峰指出，污染防治战略的实施，需要污染源监测工作的支持。加强污染源监测工作，是实施总量控制、落实污染物减排指标任务的需要。做好环境管理工作，必须掌握污染源排放数据，了解污染源排放“家底”，做到心中有数。长期以来，我国的基础监测数据严重缺失，主要工业污染源和污染物排放总量一直没有搞清，几大流域、区域的环境总量也未搞清，这与污染源监测工作长期相对滞后有直接的关系。当前，国务院决定在全国范围内开展第一次污染源普查，这是对环境监测系统工作的一次挑战和考验。
据介绍，这次全国污染源普查将采取全面调查的办法，所有排放污染物的工业源、农业源、流动源、生活源单位均作为样本单位。普查的目的就是掌握全国第一、第二、第三产业中各类污染物的数量、结构、行业和地区分布，主要污染物、排放量、排放去向、污染治理设施运行状况、污染治理水平和污染治理费用等。与经济、人口等普查不同，污染源普查中污染物排放浓度和数量不能直接从企业账簿上或文件资料中获取，必须对排污口进行现场监测，并结合企业物料衡算计算出企业全年的各类污染物排放量，这些都需要环境监测部门提供大量的监测数据和统计数据。
据了解，长期以来，污染源监测存在监测项目和监测范围较少、监测频次较低、申请监测经费难等问题，一些地方的污染源监测工作出现停滞甚至萎缩的情况。
魏山峰介绍说，20世纪80年代，在我国各地环境监测站建站初期，污染源监测均为主要业务工作。20世纪90年代初期，各地重点工业污染源的监测数据经各省环境监测中心站汇总后，每年一次报送监测总站，编写《全国重点工业污染源排放报告》；同时，各地对地方重点监控的工业污染源也开展监测。20世纪90年代后期，由于污染源情况发生较大变化、监测经费保障不足、监测数据质量出现问题等原因，《全国重点工业污染源排放报告》不再编写。
魏山峰说，目前，各地污染源监测工作主要由地市级和县级监测站承担。各地市污染源监测工作主要为排污收费、“城考”中“烟尘控制区”等指标的考核所用，少部分地区配合排污申报登记和换发排污许可证工作开展污染源监测。环境统计报表制度中规定，排污单位报告污染物排放量必须附有污染源监测数据，但在实际工作中，这一要求并未得到严格执行。
魏山峰指出，国家环保总局发布的《2006年全国环境监测工作要点》要求，各地对占全国主要污染物排放量65％的重点污染源开展监测并上报监测数据。但各地环境监测站普遍反映，申请经费时得不到支持，监测工作难以落实。从2006年第三季度废水重点污染源监测情况看，仅有12个省的99个地、市报送了废水重点污染源监测数据，占应报地、市数量的29.1％；各地上报了823家污染源监测数据，还有部分企业的基本信息未报或不全，不能确定其应执行的排放标准限值，无法进行评价；信息较全、能够进行评价的污染源仅有685家，占应报废水污染源数的20.9％。