物流功能顺利启动，替代境外一日游效果显著。保税物流园区具备多种功能，从试点单位反馈的情况看，保税仓储、国际采购、分销与配送、简单加工、转口贸易等主要物流功能在试点中都得到了不同程度的运用。如上海外高桥保税物流园区国际采购和国际配送业务已占到园区全部业务的43%，张家港则形成了进口液体化工品保税、分销集散地，深圳形成了国内采购、园区拆拼、出口境外的主要作业模式等。另外，由于保税物流园区具有入区即退税的政策优势，能更为方便的实现加工贸易上下游企业间货物的结转，降低成本，因此，吸引了大批企业通过物流园区开展“替代境外一日游”的业务。据不完全统计，2006年全国保税物流园区替代一日游进出区货值为131.4亿美元。
全面发挥保税物流园区功能
两大难点有望破解
积极开展整合创新，着力解决区港“动而不联”问题。积极发挥政府主导作用，整合行政管理资源，打破区港两家人的束缚，促使港区与园区相互渗透、相互融合，达到利益共享的格局。同时，在监管手段上，更多的要着眼海关自身进行“内部整合”，突破口岸监管与保税区域监管的界限，在满足有效监管的前提下，进行口岸与区域监管之间的有效联动。要理顺口岸与区域之间的流转通道，真正实现一次办理手续；要开展包括人员管理、设备共享、流程创新在内的监管资源的整合；要大力应用科技手段，实现信息共享，提升管理的效能和效率。
修改完善法律规章、进一步明确操作规范。针对目前呼声较高的“区区联动”问题，海关总署正进行相关立法，并将于近期出台《保税监管货物流转办法》；同时，还将尽快出台保税物流园区操作规程，目前这一项目已列入海关总署今年工作的重点，预计年内出台；此外，围绕检测、维修、研发等型新保税物流业务要尽快出台相关管理规定，特别是重点围绕保税物流园区一、二线分别监管特点、保税物流与传统口岸贸易的差异这两个方面进行相关法规的修改完善。