今年全市实施近海整治项目96个（其中80个项目要求今年完成整治任务，16个项目为跨年度实施项目）中，截至12月15日已完成61个整治项目，预计年底前有65个项目完成整治任务，完成率将达到81.3％。截至12月15日，今年全市共投入整治资金12.62亿元，其中环保基础设施建设资金7.97亿元；工业污染整治资金3.53亿元；小流域清淤、疏浚、拓改等整治资金1.01亿元；畜禽养殖污染及其他涉海项目污染的治理资金约0.112亿元。
近海水域环境污染趋势初步得到控制，水环境质量有所改善。2006年泉州市10个近海监测点位监测结果显示，水质达标率为50％，与2005年基本持平，水质比去年略有好转；其中祥芝湾、石狮东部海区、围头湾等3个点位水质达标率100％，比去年上升33.3％；深沪湾、泉州湾洛江口两个点位水质达标率均比去年上升33.3％，泉州湾晋江口、湄洲湾、惠安东部外海等3个点位水质尚未明显改善。泉州市入海主要溪流12个监测结果显示，入海溪流的工业恶性污染得到遏制，水质比整治前均有不同程度的改善。
科学规划，统筹治理。市政府把近海污染治理列为泉州市“十一五”规划的重要工作任务，由市里统一组织全市近海污染源调查，编制《泉州湾南岸近海水域污染专项整治实施方案》和《泉州市近海水域环境污染综合治理方案》。各沿海县（市、区）结合各自实际与污染源特点，配套出台区域性、行业性污染整治方案。同时，各级、各部门多方筹资，加大投入，确保各项整治任务顺利进行。
在开展近海水域环境综合整治中，各地环保基础设施建设取得重大进展，晋江市仙石污水处理厂、南安市污水处理厂投入试运行，石狮市中心区污水处理厂、惠安县城污水处理厂和泉港区生活垃圾无害化填埋场即将建成，惠安县城梅山垃圾填埋场改造工程和南安市垃圾焚烧发电厂已动工建设，晋江、石狮、南安沿海乡镇完成了20个垃圾中转站、卫生填埋场的建设。各级、各部门扎实有效地开展专项整治，工业污染得到遏制。此外，小流域、沟渠整治逐步开展，养殖业污染治理取得阶段性成效，晋江、洛阳两江流域污染治理持续深化，水质得到有效保证。